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风险一：未按时办理税务注销
目前，在公司成立阶段实行的是“先工商后税务”的处置准绳，即先停止工商注销，后停止税务注销。深圳税务机关调查显现，实行注册资本注销制度变革以来，新办税务注销征税户数增幅明显，但与深圳市市场监视管理局发布的同期新增商事注销主体数量存在一定的差距，局部新增商事主体未按期办理税务注销。
税收征管法第十五条规则，企业，企业在外地设立的分支机构和从事消费、运营的场所，个体工商户和从事消费、运营的事业单位自领取停业执照之日起30日内，持有关证件，向税务机关申报办理税务注销。
税收征管法第六十条规则，征税人未依照规则的期限申报办理税务注销、变卦或者注销注销的，由税务机关责令限期矫正，能够处2000元以下的罚款；情节严重的，处2000元以上1万元以下的罚款：征税人不办理税务注销的，由税务机关责令限期矫正；逾期不矫正的，经税务机关提请，由工商行政管理机关撤消其停业执照。
风险二：税务注销信息失真
目前，国税、地税共用一套系统，与市场监视管理局联网，自动实时采集运营范围等工商注销信息。但是关于取得的征税人数据，税务机关经过核对发现，许多新增商事主体存在法定代表人或业主不实、企业不在注册地址运营、无法联络等现象。
税收征管法施行细则第十四条规则，征税人税务注销内容发作变化的，应当自工商行政管理机关或者其他机关办理变卦注销之日起30日内，持有关证件向原税务注销机关申报办理变卦税务注销。
税收征管法第六十条第一款规则，征税人未依照规则的期限申报办理税务注销、变卦或者注销注销的，由税务机关责令限期矫正，能够处2000元以下的罚款；情节严重的，处2000元以上1万元以下的罚款。
风险三：虚假注册资金
虚假出资，指股东外表上出资而实践未出资，实质特征是股东未支付相应对价而获得公司股权。
《国度税务总局关于企业投资者投资未到位而发作的利息支出企业所得税前扣除问题的批复》（国税函〔2009〕312号）规则，凡企业投资者在规则期限内未缴足其应缴资本额的，该企业对外借款所发作的利息，相当于投资者实缴资本额与在规则期限内应缴资本额的差额应计付的利息，其不属于企业合理的支出，应由企业投资者担负，不得在计算企业应征税所得额时扣除。
风险四：股权计税根底确认
注册资本制度变革后，由实缴制改为认缴制，带来的另一个税收问题是，如何肯定原始股东股权的计税根底。这直接影响原始股东转让股权时的应税所得。
原始股东无论是货币出资还是非货币出资，出资额普通被计入实收资本，实收资本就是税法上讲的股权的计税根底。税法关于资产计税根底的普通规则是历史本钱，所谓本钱是实践发作的支出。依照上述准绳，原始股东股权的计税根底应该是实践交纳的出资额，而不应是认缴数。在交纳全部认缴数之前，股权的计税根底应该是变动的。
因而，注册资本注销制度变革后，关于原始股东股权的计税根底，假如以实践交纳的出资额为准，更契合税法关于计税根底的普通准绳。由于注册资本注销制度的变革，需求修正公司法并待人大经过之后，变革计划才干真正落实，但由此可能引发的税收问题，需求征税人格外关注。
风险五：注销清算不实
在公司股权变卦、公司注销等阶段实行“先税务后工商”的准绳，需求先了却税务问题，再停止工商变卦、注销。注册资本注销制度变革后，企业在注销清算过程的主要涉税风险，来源于企业在注销过程中未按税法规则处置涉税事项可能招致的多缴或少缴税款的风险。 有些企业被工商等部门撤消停业执照而发作解散、终止运营等情形，但企业怠于实行清算程序；有些企业在清算期间对应该、或者能够停止处置的活动资产（如存货）、固定资产（如机器设备、房屋）和无形资产（如土地运用权）等不停止处置，对有关债权和债务不及时停止清算处置；有些企业虽然实行了清算程序，但清算前并不通知税务机关，税务机关被扫除在清算之外，企业办理税务注销时也不提供清算报告。这些未标准实行税务注销清算程序的行为，都为企业带来了涉税风险。
风险六：虚开增值税专用发票
税收监管工作中，发票管理是重中之重。《国度税务总局关于征税人虚开增值税专用发票征补税款问题的公告》（国度税务总局公告2012年第33号）规则，征税人虚开增值税专用发票，未就其虚开金额申报并交纳增值税的，应依照其虚开金额补缴增值税；已就其虚开金额申报并交纳增值税的，不再依照其虚开金额补缴增值税。税务机关对征税人虚开增值税专用发票的行为，应按税收征管法及发票管理方法的有关规则给予处分。征税人获得虚开的增值税专用发票，不得作为增值税合法有效的扣税凭证抵扣其进项税额。
工商注销变革后需求研讨的几个征管难题，广州市在去年试点的根底上，于今年1月1日起在全市全面推行工商注销制度变革。统计结果显现，广州市工商注销制度变革获得了良好开端。今年1月以来，新设立工商注销主体5.16万户，同比增长38%，相当于2012年新增主体的1.73倍，注册资本金654.4亿元，同比增长117%。税源户数大幅增加。今年第一季度广州市地税税务注销新开30341户，同比增长38.4%。
在外部变革形势和内在管理请求的驱动下，必需改动过去粗放型管理方式。广州市地税局依据本身的实践状况，组织展开了一系列的变革。在广东省地税局的支持下，在撤销局部机构的根底上，从去年底先后推出税务注销属地管理、新设立大企业局、征税评价局、征税效劳分局、实行分行业稽查等。依据不同商事主体的范围、行业、注册类型等特性施行科学的分级分类管理，对详细业务事项停止合理分工，对人力资源和征管资源重新优化配置，以风险管理为导向，应用差别化和流程化管理，由原“管户制”向“管事与管户分离”的专业化管理方式转变，依照国度税务总局、市政府的行政审批制度变革和工商注销变革请求，全面推进“先办后审”，使基层管户和执法风险压力得到缓解、征管工作效率实在得到进步。
由于税收工作与社会经济范畴联络亲密，工商注销制度变革作为一项严重的行政审批制度变革，对地税工作形成的影响尤为久远而深入，在如何增强税源监控、防备执法风险等方面，依然有些难题需求持续关注和深化研讨。
一是“一址多照”或“一照多址”方式产生两个难题。“一址多照”在税务人员下户实地调查时，无法肯定实践征税人与运营地址的对应关系，税收管理员需消耗更多不用要的查证时间；“一照多址”应办理一个税务注销还是多个税务注销，这些地址之间的企业存在何种关系，如何精确划分征管归属。倡议工商注销部门在发放“一址多照”时能够将“一址”进一步细分为“xx地址之一、之二”，以便税务管理机关肯定地址的对应关系，监管部门对“一照多址”企业需求重点增强监管；税务部门也要相应跟进研讨实践操作问题，特别是税收征管法及其施行细则对注销工作的法律根据要加以完善。
二是不再对实收资本等相关信息停止工商注销，影响个人和企业所得税征管问题。工商注销机关只需求工商主体股东实践出资后30日内，向工商注销机关办理备案手续。假如征税人不来办理备案或者没有办理实收资本备案手续就发作股权转移，逃税问题显然存在。倡议修正完善相关法律，强化第三方涉税信息获得。要从国度管理体系和管理才能现代化的高度，明白相关单位提供涉税信息的义务，同时增强对股份公司资金流向的亲密监控，以便及时掌控股权转让信息。调整企业所得税管理战略，重点关注资本金变化对税基计算的影响，以及“一址多照”对征税人运营范围、范围和费用支出的信息获取和科学计算，并构成相应管理机制，使其与变革后的新形势相吻合。
三是工商主体办理了工商注销不来办理税务注销，或是办理了税务注销在获得银行开户账户、购置发票后即失踪的问题。由此招致增加催报催缴、非正常认定、追缴发票等一系列后续管理问题。在实行工商注销变革较早的深圳市此类状况曾经显现。倡议一方面修正税务注销依附于纸质停业执照的规则，改良税务注销制度，关于工商部门的电子停业执照及其提供的电子信息，停止顶层设计，从法律层面予以认可，完成电子证制度，并把包括税务注销证、工商执照、质监代码证、驾驶证、退休证、社保证、身份证等逐渐完成通用合一；另一方面继续加快税源专业化变革，以风险管理为导向，强化后续管理，改良管理方式办法，提升实践操作的管控，增强异常企业监控，优化催报催缴方式、简并小范围征税人征税申报期限。